作为教育部“三全育人”综合改革试点院系，海洋科学学院构建“本-硕-博”一体化课程，实施“十大育人体系”，打造立德树人一体化模式。
构建“本-硕-博”一体化课程体系，营造浓厚的深造氛围
学院以培养未来研究海洋的科学家为目标，按照“一级学科培养本科生；二级学科培养硕士生；三级学科培养博士生”的思路，构建了海洋科学专业“本-硕-博”一体化课程体系，较为系统地解决了本科、硕士、博士各学段课程之间的衔接问题，实现了本科、硕士、博士三个培养层次的贯通培养，立足于第一课堂主阵地，为营造升学氛围并推动本科生继续深造奠定了坚实基础。
实施大学生课外科研训练计划
学院发挥课堂主渠道作用，设置《海洋科学进展》《综合实验与实践》两门必修课，明确学分要求，强化师资队伍。同时，精心打造海洋大讲堂、学生科研兴趣小组、大学生创新科研训练计划、本科生导师制等品牌项目，引导督促低年级本科生早接触、早参与科研训练，推动学生在本科四年级全部进入导师科研团队。近年来学院累计有654名本科生参与大学生课外科研训练计划，充分发掘了学生的科研潜力，涵养了学生开拓创新的进取意识和严谨求实的科研作风，潜移默化、润物无声地提高了学生的深造率。
实施大学生海外学术交流计划
学院针对本科三年级学生，投入专项经费实施大学生海外学术交流计划，并充分调动青年教师专职辅导员、班主任和专任教师的学术资源，每年支持超过20位本科生赴国（境）外参加国际学术会议、短期研究项目或交换学习等，助推学生走近学科前沿，了解研究进展，学习先进理念。
实施毕业论文研究方舟计划
学院实施毕业论文研究方舟计划，投入专项经费资助学生开展毕业论文研究，为学生完成高质量毕业论文研究提供必要的经费支持，督促学生提高毕业论文设计和答辩质量。通过差异化支持和个性化帮扶，激励学生在国内继续攻读研究生或前往国（境）外世界排名前100名的大学深造，引导学生将本科阶段科研工作延伸至研究生阶段，实现不同学段有机衔接，螺旋上升，助力学生在研期间聚沙成塔，厚积薄发。
第二课堂与第一课堂深度融合，全面提高深造成功率
学院围绕第一课堂人才培养规律，设计开展第二课堂，通过组织“深造指导”师生午餐会、“深造经验分享会”“团藻促学计划”等活动，加强学生与教师、同辈和辅导员之间的交流互动，有效促进学生学业发展和学术成长。
组织“深造指导”师生午餐会
学院每2-3周举行一次“深造指导”师生午餐会，打破课室的空间局限，营造轻松的交流环境，在互动交流的过程中拉近师生距离，解答学生疑惑，坚定学生信心。据统计，学院每年开展深造指导主题的师生午餐会10余次，邀请专任教师约15人次有针对性地指导学生深造。
组织“深造经验分享会”
学院从优秀校友、研究生和高年级本科生中遴选优秀学子，通过分享沙龙、模拟面试等丰富多样的形式，围绕如何确立深造目标、如何提前做好深造准备、如何申请保研夏令营、如何备考研究生统一考试、如何申请国（境）外高校等主题，搭建朋辈互动平台，分享深造经验，交流升学资讯，为同学们升学深造指明方向、答疑解惑。
实施“团藻促学计划”
学院实施“团藻促学计划”，围绕考研初试科目，通过线上线下相结合的方式，遴选在读研究生为考研学生开展细致深入的学业辅导。通过这一促学计划，一方面精准辅导学生进行复习备考，进一步提高备考的针对性和实效性；另一方面通过组建朋辈互助学习小组，营造良好的学习环境和备考氛围，实现双向提高、共同进步。
未来2-3年，学院将继续深入推进教育部“三全育人”综合改革试点工作，以90%本科毕业深造为发展目标，进一步推动学生学业发展和升学深造，为实施海洋强国战略培养一批又一批理想信念坚定、专业基础扎实、专业基础扎实、不断追求卓越的未来海洋研究科学家，为实现中华民族伟大复兴的中国梦不懈努力奋斗。